В 1594 году после возведения нового острожка, большая часть людей была распущена, в Таре оставлено не более 450 человек добрых конных из литвы, черкас, казаков и стрельцов, часть которых также на зиму была уволена за жёнами. Эти люди и послужили основой новых Сибирских казаков – Тарских.
В 1596 году по грамоте воеводе князю Фёдору Борисовичу Елецкому и головам Василию Михайловичу Хлопову, Борису Доможирову и Григорию Елизарову, был назначен стрелецким сотником боярский сын Сергей Голенский на место Семёна Лодыженского, который был отпущен в Москву, так как он был послан на Тару с проездом на 3 года.
31 августа 1596 году тарские воеводы писали вестовые грамоты:
«… царь Кучум ссылается с бухарцами и ногайцами, умышляет идти войной на сибирские города. В виду этих вестей предписывается с проходящих на Тару бухарских и ногайских торговых людей (с лошадьми и разными товарами) не брать никаких пошлин, но наблюдать за ними, чтобы они в городе никаких крепостей и людей не рассматривали и не лазучили, и с русскими людьми и с татарами опричь торговли некоторых разговорных речей не говорили, и нужи б сибирской некоторые не выдали, а говорить-де им, что сибирские города доре людны и ничем не нужны…».
30 ноября 1596 года дана царская роспись «количества хлебных запасов, соли, пороху, свинцу, церковных припасов и прочего, посланных с Сибирские города: в Тобольск, Тару, Сургут, Березов, Тюмень, Пелым и Лозьву», по которой на Тару велено послать новоприборных черкас 10 человек из Москвы.
1 января 1597 года воеводы сообщали о военных действиях царя Кучума против калмыков, об отпадении от него царевичей Каная и Иледея, о сношениях Кучума с бухарцами и ногайцами, о посылки из Тары ратных людей в проезжие станицы и на сторджи и по перевозом, причём одна станица под командой Ильи Беклемешева, разгромила в сентябре 1597 года на перевозе Казме (на реке Иртыше), бухарский отряд, шедший к Кучуму, когда взято 8 полонников, уверявших о мирных целях отряда. По грамоте предписано отпустить их с их рухлядью и лошадьми в Бухарскую землю к царю Облахану, с предупреждением чтобы они не ходили к Кучуму мимо наши городы, иначе-де против бухарцев будет послана рать.